The electromagnetic performance of phased array antenna(PAA) is obviously degraded because of random errors caused by manufacturing processing and assembly. It seriously restricts the realization of high performance of active phased array antennas. By considering the mutual coupling parameter and introducing the plane structural errors into the antenna pattern function as an additional phase factor, the coupled structural-electromagnetic model is established of the relationship between the plane structural errors and the electromagnetic performance of the planar hexagonal phased array antenna. The quantitative relationship between the structural errors and the electromagnetic performance is presented with consideration of the mutual coupling. Moreover, the influence of the electromagnetic performances of antenna with the plane installation accuracy and planar tolerance is analyzed with the change in the number of array elements, to provide guidance for the antenna designers to set the tolerance in manufacturing antenna.